民國81年11月金門解除戰地政務,開放觀光後,各項建設突飛猛進,惟仍缺乏大專院校,以培育優秀人才,提昇地方之學術文化水準。經地方人士多方爭取與努力,教育部技職司吳清基司長於民國84年7月3日偕同國立高雄科學技術學院(現為國立高雄應用科技大學)黃廣志校長、及相關單位主管人員一同赴金門考察、座談,研討在金門設置二專學程之可行性。經研討決議,請國立高雄科學技術學院在金門設立分部,並於民國86年7月經教育部核定後正式成立,民國86年8月2日,教育部吳部長親赴金門主持掛牌揭幕典禮,金門第一所高等學府於焉誕生。 經過6年的經營,國立金門技術學院正式於民國92年8月1日獨立設校,首任校長為李金振博士,並由教育部長黃榮村親自主持佈達揭牌儀式。 民國99年6月14日獲教育部同意本校改名為「國立金門大學」,民國99年8月1日揭牌,李金振博士獲聘為首任校長,教育部長吳清基親臨主持佈達、授印儀式